Đoàn TNCS Hồ Chí Minh Học viện Hành chính Quốc gia là một tổ chức chính trị – xã hội, là trường học xã hội chủ nghĩa của sinh viên, là đơn vị trực tiếp tham mưu cho Đảng ủy, Ban Giám đốc Học viện trong việc thực hiện nhiệm vụ tập hợp, tổ chức, giáo dục và rèn luyện đoàn viên, sinh viên trong Học viện. Gắn liền với truyền thống 56 năm xây dựng và phát triển của Học viện, Đoàn Thanh niên không ngừng trưởng thành và phát triển, đã có những đóng góp quan trọng cho công tác Đoàn và phong trào thanh niên, sinh viên của Khối các cơ quan Trung và đặc biệt đối với quá trình xây dựng Học viện về mọi mặt.
Tự hào với truyền thống 56 năm xây dựng và phát triển của Học viện, biết bao thế hệ cán bộ, đoàn viên, sinh viên đã không ngừng kế thừa và phát huy truyền thống vẻ vang của Đoàn, vượt qua bao gian khó hy sinh để khẳng định sức trẻ của mình trên các mặt trận: giảng dạy, học tập, nghiên cứu khoa học, xây dựng tổ chức Đoàn, xây dựng Học viện, góp phần đào tạo ra những cán bộ, công chức, viên chức “vừa hồng, vừa chuyên” cho xã hội. Kế thừa và phát huy những truyền thống của tuổi trẻ Học viện, trong những năm gần đây, Đoàn Thanh niên Học viện tiếp tục thể hiện vai trò hết sức quan trọng trong công tác tổ chức, tập hợp, giáo dục và phát triển đoàn viên, sinh viên. Công tác Đoàn của Học viện đã đạt được những kết quả đáng ghi nhận thể hiện qua các mặt công tác: giáo dục chính trị tư tưởng, giáo dục đạo đức, lối sống, ý thức chấp hành pháp luật; học tập – nghiên cứu khoa học; văn hóa, văn nghệ, thể dục thể thao; sinh viên tình nguyện và trong công tác tổ chức xây dựng Đoàn, Đoàn tham gia xây dựng Đảng được quan tâm đúng mức đồng thời Đoàn Thanh niên Học viện đã luôn thể hiện tốt vai trò là nòng cốt chính trị của Hội Sinh viên.
Đoàn TNCS Hồ Chí Minh Học viện Hành chính Quốc gia là đơn vị hoạt động dưới sự chỉ đạo của Đoàn Thanh niên Bộ Nội vụ và Đảng ủy Học viện. Hiện nay, Đoàn Học viện có 42 Chi đoàn trực thuộc tại Hà Nội, 01 Đoàn cơ sở tại TP.Hồ Chí Minh (với 24 Chi đoàn) và 05 đơn vị chuyên môn gồm: Văn phòng, Ban Tuyên giáo, Ban Tổ chức, Ban Phong trào, Ban Hỗ trợ học tập và Nghiên cứu khoa học. Trong mỗi giai đoạn cách mạng, Đoàn Thanh niên Học viện luôn bám sát thực tiễn, nhiệm vụ chính trị của Học viện và Đoàn cấp trên để hoàn thành xuất sắc nhiệm vụ.
Ban Chấp hành Đoàn Thanh niên Học viện hiện nay gồm 23 đồng chí, Bí thư: Bùi Đức Minh, Phó Bí thư: Lương Văn Liệu và Ngô Đặng Tuấn Anh (kiêm Bí thư Đoàn cơ sở TP.Hồ Chí Minh).